课程建设是提高教学质量的中心环节。为了加强课程建设，打造一批精品课程，促进教学水平和教学质量不断提高，2003年5月21日学院颁布了《青岛远洋船员学院课程建设条例》。根据教育部和省教育厅的安排，9月份学院向山东省申报了第一批8门精品课程，2003年度，共批准学院级重点课程8门。11月4日学院《船舶辅机》课程通过了专家组的评审，被教育部确定为全国首批精品建设课程。

2004年学院向山东省申报了4门精品课程。经评审，《液压与气动技术》课程荣获山东省省级精品课程。（山东省共有100门课程被批准为省级精品课程，其中高职高专课程只有2门）。

2006年，学院通过山东省教育厅、交通教学指导委员会申报了三门精品课程。最终，《航海学》课程荣获了国家级精品课程称号，《航海气象与海洋学》和《轮机管理》两门课程被评为山东省精品课程。至此，我院拥有了国家级精品课程2门，省级精品课程3门，总门数在我省高职高专院校中是最多的。